Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms