Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIRMAQ69YN4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms