Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms