Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms