Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms