Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF628Q5EBL2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms