Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL39P5Q59GN2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms