Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms