Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms