Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms