Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PKDCCQ504Y2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms