Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms