Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms