Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q499Y3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q499Y3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q499Y3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q499Y3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q499Y3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q499Y3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q499Y3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q499Y3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q499Y3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q499Y3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q499Y3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q499Y3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q499Y3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q499Y3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q499Y3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q499Y3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q499Y3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q499Y3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q499Y3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q499Y3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q499Y3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q499Y3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q499Y3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q499Y3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q499Y3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q499Y3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q499Y3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q499Y3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q499Y3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q499Y3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q499Y3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q499Y3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q499Y3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q499Y3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q499Y3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q499Y3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q499Y3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q499Y3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q499Y3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q499Y3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q499Y3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q499Y3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q499Y3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q499Y3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q499Y3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q499Y3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q499Y3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q499Y3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q499Y3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Q499Y3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q499Y3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q499Y3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q499Y3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q499Y3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q499Y3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q499Y3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q499Y3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q499Y3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms