Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms