Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FHOD3Q2V2M9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms