Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms