Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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