Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms