Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CA9Q16790 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CA9Q16790 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CA9Q16790 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CA9Q16790 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CA9Q16790 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CA9Q16790 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CA9Q16790 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CA9Q16790 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CA9Q16790 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CA9Q16790 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CA9Q16790 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CA9Q16790 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CA9Q16790 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CA9Q16790 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CA9Q16790 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CA9Q16790 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CA9Q16790 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CA9Q16790 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CA9Q16790 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CA9Q16790 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CA9Q16790 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CA9Q16790 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CA9Q16790 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CA9Q16790 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CA9Q16790 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CA9Q16790 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CA9Q16790 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CA9Q16790 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CA9Q16790 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CA9Q16790 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CA9Q16790 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CA9Q16790 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CA9Q16790 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CA9Q16790 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CA9Q16790 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CA9Q16790 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CA9Q16790 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CA9Q16790 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CA9Q16790 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CA9Q16790 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CA9Q16790 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CA9Q16790 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CA9Q16790 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CA9Q16790 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CA9Q16790 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CA9Q16790 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CA9Q16790 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CA9Q16790 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CA9Q16790 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CA9Q16790 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CA9Q16790 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CA9Q16790 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CA9Q16790 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CA9Q16790 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CA9Q16790 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CA9Q16790 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CA9Q16790 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CA9Q16790 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CA9Q16790 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CA9Q16790 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CA9Q16790 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CA9Q16790 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CA9Q16790 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CA9Q16790 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CA9Q16790 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CA9Q16790 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CA9Q16790 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CA9Q16790 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CA9Q16790 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CA9Q16790 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CA9Q16790 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CA9Q16790 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CA9Q16790 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CA9Q16790 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CA9Q16790 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CA9Q16790 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CA9Q16790 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CA9Q16790 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CA9Q16790 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CA9Q16790 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CA9Q16790 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CA9Q16790 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CA9Q16790 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CA9Q16790 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CA9Q16790 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CA9Q16790 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CA9Q16790 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CA9Q16790 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CA9Q16790 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CA9Q16790 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CA9Q16790 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CA9Q16790 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CA9Q16790 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CA9Q16790 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CA9Q16790 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CA9Q16790 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CA9Q16790 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CA9Q16790 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CA9Q16790 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms