Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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LAMA3Q16787 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
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