Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
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