Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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SSX1Q16384 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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SSX1Q16384 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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SSX1Q16384 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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