Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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