Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
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NCOA1Q15788 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
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NCOA1Q15788 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
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NCOA1Q15788 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
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NCOA1Q15788 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCOA1Q15788 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
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NCOA1Q15788 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCOA1Q15788 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
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NCOA1Q15788 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NCOA1Q15788 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCOA1Q15788 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCOA1Q15788 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCOA1Q15788 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCOA1Q15788 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCOA1Q15788 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCOA1Q15788 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCOA1Q15788 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCOA1Q15788 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCOA1Q15788 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCOA1Q15788 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCOA1Q15788 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCOA1Q15788 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCOA1Q15788 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
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