Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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EFNB3Q15768 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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EFNB3Q15768 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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