Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRKQ15262 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRKQ15262 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRKQ15262 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRKQ15262 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRKQ15262 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRKQ15262 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRKQ15262 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRKQ15262 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRKQ15262 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRKQ15262 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PTPRKQ15262 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRKQ15262 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRKQ15262 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRKQ15262 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRKQ15262 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRKQ15262 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRKQ15262 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRKQ15262 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRKQ15262 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRKQ15262 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRKQ15262 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRKQ15262 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PTPRKQ15262 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRKQ15262 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRKQ15262 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRKQ15262 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRKQ15262 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRKQ15262 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRKQ15262 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRKQ15262 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRKQ15262 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRKQ15262 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRKQ15262 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRKQ15262 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRKQ15262 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRKQ15262 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRKQ15262 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRKQ15262 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRKQ15262 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRKQ15262 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRKQ15262 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRKQ15262 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRKQ15262 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRKQ15262 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRKQ15262 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRKQ15262 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRKQ15262 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRKQ15262 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRKQ15262 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRKQ15262 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRKQ15262 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRKQ15262 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRKQ15262 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRKQ15262 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRKQ15262 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRKQ15262 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PTPRKQ15262 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRKQ15262 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRKQ15262 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PTPRKQ15262 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRKQ15262 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRKQ15262 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRKQ15262 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRKQ15262 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRKQ15262 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRKQ15262 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
PTPRKQ15262 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
PTPRKQ15262 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRKQ15262 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRKQ15262 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRKQ15262 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRKQ15262 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRKQ15262 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRKQ15262 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRKQ15262 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRKQ15262 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRKQ15262 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRKQ15262 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRKQ15262 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRKQ15262 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRKQ15262 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRKQ15262 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRKQ15262 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRKQ15262 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRKQ15262 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRKQ15262 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRKQ15262 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRKQ15262 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRKQ15262 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRKQ15262 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRKQ15262 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRKQ15262 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRKQ15262 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRKQ15262 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRKQ15262 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRKQ15262 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRKQ15262 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRKQ15262 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRKQ15262 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
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