Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms