Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
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