Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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