Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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SQLEQ14534 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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