Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
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