Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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