Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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