Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
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