Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms