Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms