Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGCGQ13326 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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