Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
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