Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
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