Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms