Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
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