Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms