Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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