Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms