Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms