Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms