Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SSRP1Q08945 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SSRP1Q08945 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SSRP1Q08945 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSRP1Q08945 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSRP1Q08945 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SSRP1Q08945 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSRP1Q08945 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SSRP1Q08945 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSRP1Q08945 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SSRP1Q08945 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SSRP1Q08945 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSRP1Q08945 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SSRP1Q08945 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SSRP1Q08945 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SSRP1Q08945 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SSRP1Q08945 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SSRP1Q08945 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SSRP1Q08945 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SSRP1Q08945 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSRP1Q08945 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSRP1Q08945 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSRP1Q08945 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SSRP1Q08945 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SSRP1Q08945 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSRP1Q08945 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SSRP1Q08945 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSRP1Q08945 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SSRP1Q08945 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SSRP1Q08945 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSRP1Q08945 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSRP1Q08945 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSRP1Q08945 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SSRP1Q08945 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SSRP1Q08945 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SSRP1Q08945 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SSRP1Q08945 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SSRP1Q08945 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSRP1Q08945 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SSRP1Q08945 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSRP1Q08945 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SSRP1Q08945 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms