Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms