Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PAX8Q06710 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PAX8Q06710 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PAX8Q06710 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PAX8Q06710 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
PAX8Q06710 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PAX8Q06710 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PAX8Q06710 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX8Q06710 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX8Q06710 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX8Q06710 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX8Q06710 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PAX8Q06710 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX8Q06710 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PAX8Q06710 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PAX8Q06710 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX8Q06710 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PAX8Q06710 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PAX8Q06710 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX8Q06710 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX8Q06710 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PAX8Q06710 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX8Q06710 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX8Q06710 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX8Q06710 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX8Q06710 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PAX8Q06710 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PAX8Q06710 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX8Q06710 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX8Q06710 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PAX8Q06710 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX8Q06710 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX8Q06710 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PAX8Q06710 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX8Q06710 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX8Q06710 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX8Q06710 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX8Q06710 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX8Q06710 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PAX8Q06710 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PAX8Q06710 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX8Q06710 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX8Q06710 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX8Q06710 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX8Q06710 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX8Q06710 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PAX8Q06710 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX8Q06710 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX8Q06710 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX8Q06710 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PAX8Q06710 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX8Q06710 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX8Q06710 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX8Q06710 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PAX8Q06710 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PAX8Q06710 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX8Q06710 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX8Q06710 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PAX8Q06710 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PAX8Q06710 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PAX8Q06710 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PAX8Q06710 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PAX8Q06710 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PAX8Q06710 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX8Q06710 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms